Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1DQ9H5J8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms