Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms