Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2J2Q9GZM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms