Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms