Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms