Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPERQ9BY12 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms