Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms