Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms