Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIGD2AQ9BW72 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms