Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIRIP3Q9BW71 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIRIP3Q9BW71 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms