Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms