Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM208Q9BTX3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM208Q9BTX3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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