Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAGR1Q9BTK6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms