Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms