Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms