Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C2orf88Q9BSF0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms