Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG101Q9BSB4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG101Q9BSB4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms