Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms