Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms