Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms