Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3AQ99856 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms