Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EYA3Q99504 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms