Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms