Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1Q96NA8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms