Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL15Q96M94 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms