Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC7Q96M83 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms