Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms