Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALPK3Q96L96 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms