Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX22Q96L94 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX22Q96L94 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms