Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM87BQ96K49 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87BQ96K49 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms