Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAGED4Q96JG8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAGED4Q96JG8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAGED4Q96JG8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms