Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG3Q96JB2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms