Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SUCLG2Q96I99 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUCLG2Q96I99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms