Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPACA9Q96E40 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPACA9Q96E40 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPACA9Q96E40 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms