Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4CQ96CF2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms