Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG2BQ96BY7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG2BQ96BY7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms