Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC59Q96AG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms