Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC47Q96A33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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