Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C1Q96A29 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms