Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL2Q969S2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL2Q969S2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms