Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF34Q969K3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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