Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCE1Q969G3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCE1Q969G3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms