Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS3Q969F9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms