Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms