Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PRG4Q92954 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms