Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms