Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIFAP3Q92845 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms