Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDAQ92838 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDAQ92838 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDAQ92838 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EDAQ92838 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDAQ92838 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDAQ92838 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms