Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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RABGGTAQ92696 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGGTAQ92696 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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RABGGTAQ92696 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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RABGGTAQ92696 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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RABGGTAQ92696 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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RABGGTAQ92696 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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RABGGTAQ92696 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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RABGGTAQ92696 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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