Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
TOPBP1Q92547 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms